レビュー：Mendeleyで研究管理がもっと楽しくなる

少し前、ノースカロライナ州リサーチ・トライアングルで毎年開催される素晴らしいScience Onlineの会議で、研究管理ツールMendeleyの共同創設者の一人と夕食を共にし、とても楽しい会話を交わしました。Mendeleyは素晴らしい製品で、研究の生産性向上に大いに役立つでしょう。 

研究管理ツールとは一体何でしょうか？良い質問ですね。研究に携わる人なら誰でも知っているように、実験の実施は科学者の生活の一部に過ぎず、（滑りやすい）キャリアの階段を上るにつれて、その割合はますます小さくなっていきます。個人の研究は真空中で存在することはできません。実験台で遊んでいる時以外は、私たちは（あるいはそうあるべきですが）ひたすら読み続ける必要があります。そしてMendeleyは、その読書をより簡単にすることを目的としたプラットフォームです。

文献の追跡は不可欠ですが、時には面倒なこともあります。それでも、今の世代の研究者は、デジタル時代以前に成人した世代に比べて大きなアドバンテージを持っています。科学雑誌の出版媒体としてインターネットが広く普及したおかげで、図書館で埃っぽいアーカイブを探したり、コピー機から発生するオゾンや微粒子を吸い込んだりする時間がはるかに短くなりました。また、学部があなたのオフィスとして再利用した物置に、書類棚や、不安定に積み重なった大量の書類を置いて貴重なスペースを占領する必要もありません。

何を読んで何を読んでいないかを把握し、関連する論文を見つけるのは、依然として難しい場合があります。例えば、ハードドライブにフォルダを用意し、そこにすべてのPDFファイルをダウンロードしておき、時間をかけて名前を変更する（「first author journal year.pdf」など）という方法もあります。しかし、それでもコンテンツに集中するよりも、著者名などの詳細を覚えておく必要があります。

2007年、あるMacアプリケーションが登場し、私の人生を揺るがしました。当時、私はポスドクとして働いており、Ars Technicaに記事を書く暇は心血管疾患の研究に取り組んでいました。そのアプリケーションとはPapersで、iTunesが音楽に与えた影響と同じようなことを科学論文に与えてくれました。Papersは論文の整理整頓と、作業しやすい美しいGUIを提供してくれました。Papersは素晴らしいアプリで、今ではiOS版もありますが、Mac OS X版しかありません。当時は、そんなことは気にしていませんでした。それから3年が経ち、今では主にWindows環境で仕事をしていますが、論文を整理する必要は依然として残っています。そこでMendeleyの登場です。

Papersと同様に、MendeleyはPDFのライブラリマネージャーとして機能しますが、Papersとは異なり、アプリではありません。まあ、完全にはそうではありません。アプリは存在します。むしろ、アプリは存在します。Windows、OS X、Linux、そしてもちろんiOSにも対応しています。しかし、Mendeleyはウェブサイト上で動作するため、インストールなしでも全く問題ありません。

このウェブサイトは論文を整理するだけではありません。ソーシャルネットワーキングの要素も備えており、同じくユーザーである友人や同僚を見つけて論文を共有できます。グループ（公開グループと非公開グループの両方）に参加したり作成したり、CiteULikeなどの他のサービスと連携させたりすることも可能です。MendeleyにGmail（またはAOL、Hotmail、Yahoo、GMX）アカウントへのアクセスを許可することで、ユーザーを見つけることができます。Twitterでも同様の機能が使えるようになれば、私にとってはもっと価値があるでしょう。幸いなことに、その機能は現在開発中で、2011年春には利用可能になる予定です。

まずはWebインターフェースから見ていきましょう。まずアカウントを作成し、プランを選択します。無料プランでは、500MBの個人用ストレージと500MBの共有スペースが利用可能で、さらに最大10人のユーザーが参加できるプライベートグループを5つ作成できます。さらに、月額数ドルでより多くのWebスペースと、より多くのユーザーを擁するグループを作成できる、いくつかのレベルのサブスクリプションプランがあります。このサブスクリプションモデルのため、デスクトップアプリとiOSアプリはどちらも無料でダウンロードできます。

セットアップが完了したら、「マイライブラリ」タブで論文をアップロードして整理できます。しかし、私はこの機能をあまり使っていません。参考文献をまとめるより簡単な方法が2つあるからです。1つ目は、ジャーナルのウェブサイトで論文を読んでいるときに使える「Mendeleyにインポート」というJavaScriptブックマークです。ボタンをクリックするだけで簡単に使えます。

おそらく既に大量のPDFライブラリをお持ちであれば、デスクトップアプリをダウンロードするのが最適な方法です。Papersと同様に、ファイルをアプリにドラッグ＆ドロップし、DOI、PMID、またはArXiVカタログ参照を使用して、公開研究データベースから適切なメタデータを取得できます。ISBNによる検索はほとんど役に立たないことを付け加えておきますが、PapersでもISBN検索はうまくいかないので、これはおそらくどちらのアプリでもなく、ISBNデータベースの機能の問題でしょう。

Mendeleyはフォルダを監視する設定も可能で、起動時にフォルダをスキャンして、追加が必要な新しいファイルがあるかどうかを確認します。また、EndNoteやZoteroから参考文献をインポートしたり、データベースをEndNote XML、RIS、BibTex形式でエクスポートしたりすることも可能です。MendeleyにPDFを整理させるかどうかも選択できるので、ワークフローに合わせてカスタマイズできます。